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Literatur
vom 14.7.2021
Shape based indexing for faster search of RNA family databases
Janssen, Stefan
;
Reeder, Jens
;
Giegerich, Robert
In: BMC Bioinformatics, Jg. 9 H. 1, S. 131 ff.
pknotsRG: RNA pseudoknot folding including near-optimal structures and sliding windows
Reeder, Jens
;
Steffen, Peter
;
Giegerich, Robert
In: NUCLEIC ACIDS RESEARCH, Jg. 35 H. Web Server, S. W320-W324
KnotInFrame: prediction of –1 ribosomal frameshift events
Theis, Corinna
;
Reeder, Jens
;
Giegerich, Robert
In: Nucleic Acids Research, Jg. 36 H. 18, S. 6013-6020
vom 13.7.2021
Design, implementation and evaluation of a practical pseudoknot folding algorithm based on thermodynamics
Reeder, Jens
;
Giegerich, Robert
In: BMC Bioinformatics, Jg. 5 H. 1
Algorithms for RNA secondary structure analysis : prediction of pseudoknots and the consensus shapes approach
Reeder, Jens
2007