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Divide-and-conquer multiple alignment with segment-based constraints
Sammeth, Michael
;
Morgenstern, Burkhard
;
Stoye, Jens
In: BIOINFORMATICS, Jg. 19 H. Suppl 2, S. ii189-ii195
Efficient implementation of lazy suffix trees
Giegerich, Robert
;
Kurtz, Stefan
;
Stoye, Jens
In: SOFTWARE-PRACTICE & EXPERIENCE, Jg. 33 H. 11, S. 1035-1049
On the Similarity of Sets of Permutations and its Applications to Genome Comparison
Bergeron, Anne
;
Stoye, Jens
QAlign: quality-based multiple alignments with dynamic phylogenetic analysis
Sammeth, Michael
;
Rothgänger, Jörg
;
Esser, Wolfram
;
Albert, Jürgen
;
Stoye, Jens
;
Harmsen, Dag
In: BIOINFORMATICS, Jg. 19 H. 12, S. 1592-1593
Suffix Tree Construction and Storage with Limited Main Memory
Schürmann, Klaus-Bernd
;
Stoye, Jens