Stemmer, Nina: Alzheimer-Krankheit : Bindepartner und Prozessierung des Amyloid Precursor Proteins. 2008
Inhalt
- Erklärung
- Inhaltsverzeichnis
- Kurzfassung
- Abstract
- Einleitung
- Die Alzheimer-Krankheit
- Amyloid Plaques und A Toxizität
- Das Zelladhäsionsmolekül APP
- Prozessierung von APP
- Mutationen des Amyloid Precursor Proteins
- -Sekretase
- -Sekretase
- Das Zelladhäsionsmolekül L1
- APP-Bindepartner
- Proteasen
- Aufgabenstellung
- Material
- Allgemeine Chemikalien und Verbrauchsmaterialien
- Reaktionskits und Enzyme
- Antibiotika
- Detergenzien
- Inhibitoren
- Zelllinien
- Basiszelllinien
- Stabil transfizierte Zelllinien
- Kultivierung und Langzeitlagerung von Zellen
- E.coli-Stämme
- Vektoren
- Expressionskonstrukte
- Antikörper
- Metalloproteasen
- Peptide
- GST-Proteine
- Molekulargewicht-Standards
- Häufig verwendete Lösungen und Puffer
- Methoden
- Biochemische Methoden
- Eindimensionale SDS-PAGE (Polyacrylamid-Gelelektrophorese)
- Trizin-SDS-PAGE
- Zymographie
- SDS-Gelfärbung
- Immunoblot-Analyse
- Proteinfällung
- Bestimmung der Gesamtproteinkonzentration (BCA-Test)
- Zellfraktionierung
- Herstellung eines Mausgehirn-Homogenates
- Herstellung der löslichen Fraktion S1 und des „17000 g“ - Sedimentes3 aus Mausgehirn-Homogenat
- Isolierung von Fraktionen, angereichert mit Synaptosomen, Myelin, Axolemma und Mitochondrien
- Lösen von Membranbestandteilen
- Aufreinigung des anti-D-Antikörpers
- Isolierung des anti-D-IgG mit Hilfe des DEAE Kit (Bio-Rad)
- Isolierung des anti-D-IgG durch Protein A
- Konzentration einer Probe
- Herstellung einer Säule für die Affinitätschromatographie
- Kopplung des anti-D IgG an die Matrix einer CarboLink Säule
- Kopplung des anti-D-IgG an CNBr-aktivierte Sepharose-4B
- Affinitätschromatographie
- Probenvorbereitung für die Sequenzanalyse
- Immunpräzipitation
- Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA)
- Aufreinigung der GST-Proteine
- pulldown-Untersuchung
- -Sekretasekomplex Isolierung
- -Sekretase Aktivitätsbestimmung
- in vitro -Sekretaseaktivitätsuntersuchung
- Oberflächenbiotinylierung
- in vitro-Spaltexperimente
- Molekularbiologische Methoden
- PCR
- Aufreinigung von PCR-Produkten
- Restriktionsverdau
- Gelelektrophoretische Auftrennung von DNS
- Ligation von DNS
- Transformation von Bakterien
- Minipräparation von Plasmid-DNS aus E.coli-Bakterienkulturen
- Maxipräparation von Plasmid-DNS aus E.coli-Bakterienkulturen
- DNS-Isolation aus Agarosegelen
- DNS-Reinheitsanalyse und -Konzentrationsbestimmung
- DNS-Sequenzierung
- Zellbiologische Methoden
- Transiente Transfektion
- Aufarbeitung von Zellen und Zellkulturüberständen
- Durchflusszytometrie
- Primärzellkultur
- Immunhistochemie
- Theoretische Analyse
- Ergebnisse
- Identifikation APP-bindender Proteine
- Studie 1: Identifizierung neuer Bindepartner der APP -Spaltstelle
- Charakterisierung der anti-D-Antikörper
- Expression von APP in den verschieden Gehirnfraktionen
- Charakterisierung der vom anti-D-IgG erkannten Proteine
- Affinitätschromatographie
- Sequenzanalyse der ausgeschnittenen Proteinbanden
- Überprüfen des Vorkommens der identifizierten Proteine in den, durch die Affinitätschromatographie erhaltenen, Elutionsfraktionen
- Überprüfen einer möglichen Interaktion der identifizierten Proteine und APP mittels Co-Immunpräzipitation
- Überprüfen einer Bindung der Na+-/K+-ATPase und APP mittels ELISA
- Überprüfen einer Bindung der möglichen APP-Bindepartner und Presenilin mittels Co-Immunpräzipitation
- Studie 2: Charakterisierung der Interaktion von APP und der CK-B
- Studie 3: Charakterisierung der Interaktion von CRT und APP hinsichtlich APP--Spaltung
- Bestätigung der Bindung von CRT und APP mittels Co-Immunpräzipitation
- Überprüfen einer Bindung von CRT und C99-APP mittels Co-Immunpräzipitation
- Charakterisierung der Bindung von CRT und C99-APP durch Pulldown-Untersuchungen
- Überprüfen einer Bindung von CRT und PS1 durch Co-Immunpräzipitation
- Bestätigung einer Interaktion von APP, CRT und PS1 mittels Co-Lokalisations-Experimenten
- Charakterisierung der Bindung von CRT und PS1 durch pulldownUntersuchungen
- Isolierung des -Sekretasekomplexes
- Aufreinigung der -Sekretase in vier Schritten
- Überprüfen einer Bindung von CRT und NCT, APH-1 sowie PEN-2 mittels Co-Immunpräzipitation
- Charakterisierung der Interaktion von CRT und NCT durch Pulldown-Untersuchungen
- Analyse eines Einflusses von CRT auf die -Spaltung von APP
- Analyse der Zelloberflächenkonzentration von APP mittels Oberflächenbiotinylierung
- Analyse der Zelloberflächenkonzentration von APP mittels Durchflusszytometrie
- -Sekretase-Aktivitätsbestimmung mittels ELISA
- in vitro--Sekretase-Aktivitätsuntersuchung
- Analyse des PS1-Einflusses auf CRT
- Überprüfen einer Interaktion von CRT und L1 mittels Co-Immunpräzipitation
- Charakterisierung der Interaktion von CRT und L1 mittels Co-Immunpräzipitation
- Analyse eines CRT-Einflussses auf die Expression und Lokalisation von L1
- Prozessierung der Zelladhäsionsmoleküle APP und L1
- Diskussion
- Diskussion der möglichen Bindepartner von APP und der daraus ersichtlichen Funktionen
- Kreatinkinase-B: ein APP-Bindepartner? - Kritische Einschätzung der angewandten Methoden
- Charakterisierung der Interaktion von APP und CRT
- Metalloprotease-vermittelte Spaltung der Zelladhäsionsmoleküle APP und L1
- Allgemeine Einschätzung der Ergebnisse
- Literatur
- Anhang A Akzessionsnummer
- Anhang B Oligonukleotide
- Anhang C Plasmide
- Abkürzungsverzeichnis
- Abbildungsverzeichnis
- Tabellenverzeichnis
- Danksagung
