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Affix Trees
Stoye, Jens
2000
Alignment of Tandem Repeats with Excision, Duplication, Substitution and Indels (EDSI)
Sammeth, Michael
;
Stoye, Jens
2005
Counting Suffix Arrays and Strings
Schürmann, Klaus-Bernd
;
Stoye, Jens
2005
On Common Intervals with Errors
Chauve, Cedric
;
Diekmann, Yoan
;
Heber, Steffen
;
Mixtacki, Julia
;
Rahmann, Sven
;
Stoye, Jens
2006
On the Similarity of Sets of Permutations and its Applications to Genome Comparison
Bergeron, Anne
;
Stoye, Jens
2003
Online Abelian Pattern Matching
Ejaz, Tahir
;
Rahmann, Sven
;
Stoye, Jens
2008
A space efficient representation for sparse de Bruijn subgraphs
Quitzau, José Augusto Amgarten
;
Stoye, Jens
2008
Suffix Tree Construction and Storage with Limited Main Memory
Schürmann, Klaus-Bernd
;
Stoye, Jens
2003